Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5640A3KG49 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms