Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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