Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Fam43bA2AM80 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Fam43bA2AM80 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Fam43bA2AM80 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Fam43bA2AM80 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Fam43bA2AM80 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Fam43bA2AM80 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Fam43bA2AM80 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Fam43bA2AM80 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Fam43bA2AM80 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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