Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SetxA2AKX3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms