Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Frmpd1A2AKB4 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Frmpd1A2AKB4 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Frmpd1A2AKB4 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Frmpd1A2AKB4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Frmpd1A2AKB4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Frmpd1A2AKB4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd1A2AKB4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms