Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms