Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprfA2A8L5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PtprfA2A8L5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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