Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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