Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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