Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
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