Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms