Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lgr5Q9Z1P4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms