Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trpc2Q9R244 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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