Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma1Q9R1P4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms