Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf7Q9R1C0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms