Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Col4a3Q9QZS0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Col4a3Q9QZS0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms