Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms