Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim44Q9QXA7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim44Q9QXA7 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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