Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms