Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nectin3Q9JLB9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nectin3Q9JLB9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nectin3Q9JLB9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nectin3Q9JLB9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nectin3Q9JLB9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Nectin3Q9JLB9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Nectin3Q9JLB9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Nectin3Q9JLB9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Nectin3Q9JLB9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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