Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancaQ9JL70 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms