Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Tuba8Q9JJZ2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Tuba8Q9JJZ2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Tuba8Q9JJZ2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Tuba8Q9JJZ2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tuba8Q9JJZ2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tuba8Q9JJZ2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tuba8Q9JJZ2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tuba8Q9JJZ2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Tuba8Q9JJZ2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Tuba8Q9JJZ2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tuba8Q9JJZ2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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