Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms