Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lmbr1Q9JIT0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lmbr1Q9JIT0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lmbr1Q9JIT0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Lmbr1Q9JIT0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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