Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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Trim39Q9ESN2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim39Q9ESN2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms