Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DysfQ9ESD7 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms