Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms