Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms