Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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