Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Pop5Q9DB28 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms