Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Tmem239Q9DA47 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Tmem239Q9DA47 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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