Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Jam3Q9D8B7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Jam3Q9D8B7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms