Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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