Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms