Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Zc2hc1bQ9D534 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms