Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm3404Q9D506 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm3404Q9D506 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3404Q9D506 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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