Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2al3Q9D4U4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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