Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy3Q9D394 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms