Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms