Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pramef12Q9D2F1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef12Q9D2F1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms