Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snapc3Q9D2C9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms