Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Trappc6bQ9D289 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Trappc6bQ9D289 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Trappc6bQ9D289 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Trappc6bQ9D289 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Trappc6bQ9D289 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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