Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms