Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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