Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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