Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Sgo1Q9CXH7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Sgo1Q9CXH7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Sgo1Q9CXH7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Sgo1Q9CXH7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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