Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms