Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ddx28Q9CWT6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddx28Q9CWT6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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