Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms