Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl35Q9CQL6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms